Descripción
Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium is a sampling event dataset published by the Research Institute of Nature and Forest (INBO). This dataset contains observations of a survey of attics of old buildings (mainly churches, but also other historic buildings) at which (presumably) bat droppings were collected and identified using DNA barcoding (16S of CytB).
The dataset is published as a standardized Darwin Core Archive and includes for each sampling event an eventID, date, location and event remarks l (in the event core), and for each occurrence an occurrenceID, status, scientific name, taxon rank, materialSampleID, materialEntityID and remarks about material entity, occurrence or identification (in the occurrence extension), beside a target gene, forward and reverse primer and sequencing method (in the DNA derived data extension).
We have released this dataset to the public domain under a Creative Commons Zero waiver. We would appreciate it if you follow the INBO norms for data use (https://www.inbo.be/en/norms-data-use) when using the data. If you have any questions regarding this dataset, don't hesitate to contact us via the contact information provided in the metadata or via opendata@inbo.be.
Registros
Los datos en este recurso de evento de muestreo han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 541 registros.
también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.
Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.
Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
¿Cómo referenciar?
Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:
Dekeukeleire D, Adriaensens L, Boers K, Brosens D, Cooleman S, De Man T, Dekeyser L, Halfmaerten D, Neyrinck S, Schepers R, Van Liefferinge N, Vandendriessche B, Vermeiren H, Verschaeve L, Willems W (2025). Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium. Version 1.0. Research Institute for Nature and Forest (INBO). Samplingevent dataset. https://ipt.inbo.be/resource?r=bat-droppings-dna-survey-occurrences&v=1.0
Derechos
Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:
El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Research Institute for Nature and Forest (INBO). En la medida de lo posible según la ley, el publicador ha renunciado a todos los derechos sobre estos datos y los ha dedicado al Dominio público (CC0 1.0). Los usuarios pueden copiar, modificar, distribuir y utilizar la obra, incluso con fines comerciales, sin restricciones.
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 8062606b-4326-47a6-b89d-7a4c33b98f51. Research Institute for Nature and Forest (INBO) publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Belgian Biodiversity Platform.
Palabras clave
Samplingevent; Bats; attics; DNA-barcoding; faeces; Flanders
Contactos
- Proveedor De Los Metadatos ●
- Originador ●
- Punto De Contacto
https://orcid.org/0000-0003-0664-8396
- Originador
- Originador
- Originador
- Proveedor De Los Metadatos ●
- Originador
- Originador
- Originador
- Originador
- Originador
- Originador
- Originador
- Originador
- Originador
Cobertura geográfica
Belgium
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [50,02, 2,61], Latitud Máxima Longitud Máxima [51,5, 5,89] |
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Cobertura taxonómica
The target species of this dataset are bats (Chiroptera species). Other species recorded (mainly rodents and shrews) are also included.
| Reino | Animalia |
|---|---|
| Class | Mammalia |
| Orden | Chiroptera |
Cobertura temporal
| Fecha Inicial / Fecha Final | 1995-08-07 / 2025-01-08 |
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Métodos de muestreo
Presumably bat droppings (fecal samples) were collected using pincers and stored in an eppendorf tube with absolute ethanol until DNA extraction. It was tried to collect the most recent dropping.
| Área de Estudio | 534 sites across Flanders were visited, mainly attics of churches and other historical buildings, to inspect for roosting bats. For species identification, presumably bat droppings were collected. Most sites were only visited once. Species identification was done using DNA barcoding (targeting a fragment of mitochondrial genes 16S of CytB). |
|---|---|
| Control de Calidad | Data are collected using predefined sampling protocols. |
Descripción de la metodología paso a paso:
- Researchers from INBO and Natuurpunt Studie define and document the appropriate sampling protocols for the target species.
- Based on fieldwork and site visits, samples and data are collected by experts and specialized volunteers, using the predefined sampling protocols.
- Based on laboratory analyses, taxon identifications are assigned to the original data in Google sheets.
- Datacleaning in R en checks on map in QGIS.
- A custom data wrangling is applied in OpenRefine and R to map the original data to Darwin Core as an event core, occurrence extension and an DNA derived data extension.
- The Darwin Core views are connected to the INBO IPT and documented with metadata.
- The dataset is published and registered with GBIF.
Referencias bibliográficas
- Dekeukeleire, D., & Veltjen, E. (2025). DMP voor inventarisatie (kraam)kolonies van vleermuizen op warme zolders: versie 1. Instituut voor Natuur‐ en Bosonderzoek, België. https://pureportal.inbo.be/nl/publications/dmp-voor-inventarisatie-kraamkolonies-van-vleermuizen-op-warme-zo/
Metadatos adicionales
We would like to thank the owners of the buildings that were surveyed in this dataset. Furthermore, we would like to thank the volunteers for their input in creating the dataset.
| Identificadores alternativos | https://ipt.inbo.be/resource?r=bat-droppings-dna-survey-occurrences |
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