Description
Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium is a sampling event dataset published by the Research Institute of Nature and Forest (INBO). This dataset contains observations of a survey of attics of old buildings (mainly churches, but also other historic buildings) at which (presumably) bat droppings were collected and identified using DNA barcoding (16S of CytB).
The dataset is published as a standardized Darwin Core Archive and includes for each sampling event an eventID, date, location and event remarks l (in the event core), and for each occurrence an occurrenceID, status, scientific name, taxon rank, materialSampleID, materialEntityID and remarks about material entity, occurrence or identification (in the occurrence extension), beside a target gene, forward and reverse primer and sequencing method (in the DNA derived data extension).
We have released this dataset to the public domain under a Creative Commons Zero waiver. We would appreciate it if you follow the INBO norms for data use (https://www.inbo.be/en/norms-data-use) when using the data. If you have any questions regarding this dataset, don't hesitate to contact us via the contact information provided in the metadata or via opendata@inbo.be.
Enregistrements de données
Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 541 enregistrements.
2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Dekeukeleire D, Adriaensens L, Boers K, Brosens D, Cooleman S, De Man T, Dekeyser L, Halfmaerten D, Neyrinck S, Schepers R, Van Liefferinge N, Vandendriessche B, Vermeiren H, Verschaeve L, Willems W (2025). Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium. Version 1.0. Research Institute for Nature and Forest (INBO). Samplingevent dataset. https://ipt.inbo.be/resource?r=bat-droppings-dna-survey-occurrences&v=1.0
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Research Institute for Nature and Forest (INBO). En vertu de la loi, l'éditeur a abandonné ses droits par rapport à ces données et les a dédié au Domaine Public (CC0 1.0). Les utilisateurs peuvent copier, modifier, distribuer et utiliser ces travaux, incluant des utilisations commerciales, sans aucune restriction.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 8062606b-4326-47a6-b89d-7a4c33b98f51. Research Institute for Nature and Forest (INBO) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Belgian Biodiversity Platform.
Mots-clé
Samplingevent; Bats; attics; DNA-barcoding; faeces; Flanders
Contacts
- Fournisseur Des Métadonnées ●
- Créateur ●
- Personne De Contact
https://orcid.org/0000-0003-0664-8396
- Créateur
- Créateur
- Créateur
- Fournisseur Des Métadonnées ●
- Créateur
- Créateur
- Créateur
- Créateur
- Créateur
- Créateur
- Créateur
- Créateur
- Créateur
Couverture géographique
Belgium
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [50,02, 2,61], Nord Est [51,5, 5,89] |
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Couverture taxonomique
The target species of this dataset are bats (Chiroptera species). Other species recorded (mainly rodents and shrews) are also included.
| Kingdom | Animalia |
|---|---|
| Class | Mammalia |
| Order | Chiroptera |
Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 1995-08-07 / 2025-01-08 |
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Méthodes d'échantillonnage
Presumably bat droppings (fecal samples) were collected using pincers and stored in an eppendorf tube with absolute ethanol until DNA extraction. It was tried to collect the most recent dropping.
| Etendue de l'étude | 534 sites across Flanders were visited, mainly attics of churches and other historical buildings, to inspect for roosting bats. For species identification, presumably bat droppings were collected. Most sites were only visited once. Species identification was done using DNA barcoding (targeting a fragment of mitochondrial genes 16S of CytB). |
|---|---|
| Contrôle qualité | Data are collected using predefined sampling protocols. |
Description des étapes de la méthode:
- Researchers from INBO and Natuurpunt Studie define and document the appropriate sampling protocols for the target species.
- Based on fieldwork and site visits, samples and data are collected by experts and specialized volunteers, using the predefined sampling protocols.
- Based on laboratory analyses, taxon identifications are assigned to the original data in Google sheets.
- Datacleaning in R en checks on map in QGIS.
- A custom data wrangling is applied in OpenRefine and R to map the original data to Darwin Core as an event core, occurrence extension and an DNA derived data extension.
- The Darwin Core views are connected to the INBO IPT and documented with metadata.
- The dataset is published and registered with GBIF.
Citations bibliographiques
- Dekeukeleire, D., & Veltjen, E. (2025). DMP voor inventarisatie (kraam)kolonies van vleermuizen op warme zolders: versie 1. Instituut voor Natuur‐ en Bosonderzoek, België. https://pureportal.inbo.be/nl/publications/dmp-voor-inventarisatie-kraamkolonies-van-vleermuizen-op-warme-zo/
Métadonnées additionnelles
We would like to thank the owners of the buildings that were surveyed in this dataset. Furthermore, we would like to thank the volunteers for their input in creating the dataset.
| Identifiants alternatifs | https://ipt.inbo.be/resource?r=bat-droppings-dna-survey-occurrences |
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