Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium

Événement déchantillonnage
Dernière version Publié par Research Institute for Nature and Forest (INBO) le nov. 20, 2025 Research Institute for Nature and Forest (INBO)
Accueil:
https://www.vlaanderen.be/inbo/projecten/dna-analyse-vleermuizen-evinbo
Date de publication:
20 novembre 2025
Licence:
CC0 1.0

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Description

Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium is a sampling event dataset published by the Research Institute of Nature and Forest (INBO). This dataset contains observations of a survey of attics of old buildings (mainly churches, but also other historic buildings) at which (presumably) bat droppings were collected and identified using DNA barcoding (16S of CytB).The dataset is published as a standardized Darwin Core Archive and includes for each sampling event an eventID, date, location and event remarks l (in the event core), and for each occurrence an occurrenceID, status, scientific name, taxon rank, materialSampleID, materialEntityID and remarks about material entity, occurrence or identification (in the occurrence extension), beside a target gene, forward and reverse primer and sequencing method (in the DNA derived data extension).We have released this dataset to the public domain under a Creative Commons Zero waiver. We would appreciate it if you follow the INBO norms for data use (https://www.inbo.be/en/norms-data-use) when using the data. If you have any questions regarding this dataset, don't hesitate to contact us via the contact information provided in the metadata or via opendata@inbo.be.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme dune Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant quensemble dun ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 541 enregistrements.

2 tableurs de données dextension existent également. Un enregistrement dextension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre denregistrements dans chaque tableur de données dextension est illustré ci-dessous.

Event (noyau)
541
dnaDerivedData 
898
Occurrence 
898

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous naffiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Dekeukeleire D, Adriaensens L, Boers K, Brosens D, Cooleman S, De Man T, Dekeyser L, Halfmaerten D, Neyrinck S, Schepers R, Van Liefferinge N, Vandendriessche B, Vermeiren H, Verschaeve L, Willems W (2025). Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium. Version 1.0. Research Institute for Nature and Forest (INBO). Samplingevent dataset. https://ipt.inbo.be/resource?r=bat-droppings-dna-survey-occurrences&v=1.0

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Research Institute for Nature and Forest (INBO). En vertu de la loi, léditeur a abandonné ses droits par rapport à ces données et les a dédié au Domaine Public (CC0 1.0). Les utilisateurs peuvent copier, modifier, distribuer et utiliser ces travaux, incluant des utilisations commerciales, sans aucune restriction.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède lUUID GBIF suivante : 8062606b-4326-47a6-b89d-7a4c33b98f51.  Research Institute for Nature and Forest (INBO) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec lapprobation du Belgian Biodiversity Platform.

Mots-clé

Samplingevent; Bats; attics; DNA-barcoding; faeces; Flanders

Contacts

Daan Dekeukeleire
  • Fournisseur Des Métadonnées ●
  • Créateur ●
  • Personne De Contact
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Loes Adriaensens
  • Créateur
Natuurpunt
BE
Kris Boers
  • Créateur
Natuurpunt Vleermuizenwerkgroep
BE
Dimitri Brosens
  • Créateur
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Stijn Cooleman
  • Fournisseur Des Métadonnées ●
  • Créateur
Research Institute for Nature and Forest (INBO) / Belgian Biodiversity Platform
BE
Tobi De Man
  • Créateur
Regionaal Landschap Schelde-Durme
BE
Lars Dekeyser
  • Créateur
Regionaal Landschap Meetjesland en Leie
BE
David Halfmaerten
  • Créateur
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Sabrina Neyrinck
  • Créateur
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Robbert Schepers
  • Créateur
Regionaal Landschap Schelde-Durme
BE
Nancy Van Liefferinge
  • Créateur
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Bob Vandendriessche
  • Créateur
Natuurpunt Vleermuizenwerkgroep
BE
Hans Vermeiren
  • Créateur
Natuurpunt Vleermuizenwerkgroep
BE
Leen Verschaeve
  • Créateur
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Wout Willems
  • Créateur
Natuurpunt
BE
Natuurpunt Vleermuizenwerkgroep Vlaanderen
vleermuizen@natuurpunt.be
Regionaal Landschap Schelde-Durme
info@rlsd.be
Regionaal Landschap Meetjesland en Leie
info@rlml.be

Couverture géographique

Belgium

Enveloppe géographique Sud Ouest [50,02, 2,61], Nord Est [51,5, 5,89]

Couverture taxonomique

The target species of this dataset are bats (Chiroptera species). Other species recorded (mainly rodents and shrews) are also included.

Kingdom Animalia
Class Mammalia
Order Chiroptera

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 1995-08-07 / 2025-01-08

Méthodes déchantillonnage

Presumably bat droppings (fecal samples) were collected using pincers and stored in an eppendorf tube with absolute ethanol until DNA extraction. It was tried to collect the most recent dropping.

Etendue de létude 534 sites across Flanders were visited, mainly attics of churches and other historical buildings, to inspect for roosting bats. For species identification, presumably bat droppings were collected. Most sites were only visited once. Species identification was done using DNA barcoding (targeting a fragment of mitochondrial genes 16S of CytB).
Contrôle qualité Data are collected using predefined sampling protocols.

Description des étapes de la méthode:

  1. Researchers from INBO and Natuurpunt Studie define and document the appropriate sampling protocols for the target species.
  2. Based on fieldwork and site visits, samples and data are collected by experts and specialized volunteers, using the predefined sampling protocols.
  3. Based on laboratory analyses, taxon identifications are assigned to the original data in Google sheets.
  4. Datacleaning in R en checks on map in QGIS.
  5. A custom data wrangling is applied in OpenRefine and R to map the original data to Darwin Core as an event core, occurrence extension and an DNA derived data extension.
  6. The Darwin Core views are connected to the INBO IPT and documented with metadata.
  7. The dataset is published and registered with GBIF.

Citations bibliographiques

  1. Dekeukeleire, D., & Veltjen, E. (2025). DMP voor inventarisatie (kraam)kolonies van vleermuizen op warme zolders: versie 1. Instituut voor Natuur‐ en Bosonderzoek, België. https://pureportal.inbo.be/nl/publications/dmp-voor-inventarisatie-kraamkolonies-van-vleermuizen-op-warme-zo/

Métadonnées additionnelles

We would like to thank the owners of the buildings that were surveyed in this dataset. Furthermore, we would like to thank the volunteers for their input in creating the dataset.

Identifiants alternatifs https://ipt.inbo.be/resource?r=bat-droppings-dna-survey-occurrences