Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium

Sampling event
最新バージョン Research Institute for Nature and Forest (INBO) により出版 11月 20, 2025 Research Institute for Nature and Forest (INBO)

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード:

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 541 レコード English で (45 KB) - 更新頻度: as needed
EML ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (19 KB)
RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (15 KB)

説明

Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium is a sampling event dataset published by the Research Institute of Nature and Forest (INBO). This dataset contains observations of a survey of attics of old buildings (mainly churches, but also other historic buildings) at which (presumably) bat droppings were collected and identified using DNA barcoding (16S of CytB).

The dataset is published as a standardized Darwin Core Archive and includes for each sampling event an eventID, date, location and event remarks l (in the event core), and for each occurrence an occurrenceID, status, scientific name, taxon rank, materialSampleID, materialEntityID and remarks about material entity, occurrence or identification (in the occurrence extension), beside a target gene, forward and reverse primer and sequencing method (in the DNA derived data extension).

We have released this dataset to the public domain under a Creative Commons Zero waiver. We would appreciate it if you follow the INBO norms for data use (https://www.inbo.be/en/norms-data-use) when using the data. If you have any questions regarding this dataset, don't hesitate to contact us via the contact information provided in the metadata or via opendata@inbo.be.

データ レコード

この sampling event リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、541 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは2 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Event (コア)
541
dnaDerivedData 
898
Occurrence 
898

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Dekeukeleire D, Adriaensens L, Boers K, Brosens D, Cooleman S, De Man T, Dekeyser L, Halfmaerten D, Neyrinck S, Schepers R, Van Liefferinge N, Vandendriessche B, Vermeiren H, Verschaeve L, Willems W (2025). Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium. Version 1.0. Research Institute for Nature and Forest (INBO). Samplingevent dataset. https://ipt.inbo.be/resource?r=bat-droppings-dna-survey-occurrences&v=1.0

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Research Institute for Nature and Forest (INBO)。 To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 8062606b-4326-47a6-b89d-7a4c33b98f51が割り当てられています。   Belgian Biodiversity Platform によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているResearch Institute for Nature and Forest (INBO) が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Samplingevent; Bats; attics; DNA-barcoding; faeces; Flanders

連絡先

Daan Dekeukeleire
  • メタデータ提供者
  • 最初のデータ採集者
  • 連絡先
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Loes Adriaensens
  • 最初のデータ採集者
Natuurpunt
BE
Kris Boers
  • 最初のデータ採集者
Natuurpunt Vleermuizenwerkgroep
BE
Dimitri Brosens
  • 最初のデータ採集者
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Stijn Cooleman
  • メタデータ提供者
  • 最初のデータ採集者
Research Institute for Nature and Forest (INBO) / Belgian Biodiversity Platform
BE
Tobi De Man
  • 最初のデータ採集者
Regionaal Landschap Schelde-Durme
BE
Lars Dekeyser
  • 最初のデータ採集者
Regionaal Landschap Meetjesland en Leie
BE
David Halfmaerten
  • 最初のデータ採集者
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Sabrina Neyrinck
  • 最初のデータ採集者
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Robbert Schepers
  • 最初のデータ採集者
Regionaal Landschap Schelde-Durme
BE
Nancy Van Liefferinge
  • 最初のデータ採集者
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Bob Vandendriessche
  • 最初のデータ採集者
Natuurpunt Vleermuizenwerkgroep
BE
Hans Vermeiren
  • 最初のデータ採集者
Natuurpunt Vleermuizenwerkgroep
BE
Leen Verschaeve
  • 最初のデータ採集者
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Wout Willems
  • 最初のデータ採集者
Natuurpunt Vleermuizenwerkgroep Vlaanderen
Regionaal Landschap Schelde-Durme
info@rlsd.be
Regionaal Landschap Meetjesland en Leie
info@rlml.be

地理的範囲

Belgium

座標(緯度経度) 南 西 [50.02, 2.61], 北 東 [51.5, 5.89]

生物分類学的範囲

The target species of this dataset are bats (Chiroptera species). Other species recorded (mainly rodents and shrews) are also included.

Kingdom Animalia
Class Mammalia
Order Chiroptera

時間的範囲

開始日 / 終了日 1995-08-07 / 2025-01-08

収集方法

Presumably bat droppings (fecal samples) were collected using pincers and stored in an eppendorf tube with absolute ethanol until DNA extraction. It was tried to collect the most recent dropping.

Study Extent 534 sites across Flanders were visited, mainly attics of churches and other historical buildings, to inspect for roosting bats. For species identification, presumably bat droppings were collected. Most sites were only visited once. Species identification was done using DNA barcoding (targeting a fragment of mitochondrial genes 16S of CytB).
Quality Control Data are collected using predefined sampling protocols.

Method step description:

  1. Researchers from INBO and Natuurpunt Studie define and document the appropriate sampling protocols for the target species.
  2. Based on fieldwork and site visits, samples and data are collected by experts and specialized volunteers, using the predefined sampling protocols.
  3. Based on laboratory analyses, taxon identifications are assigned to the original data in Google sheets.
  4. Datacleaning in R en checks on map in QGIS.
  5. A custom data wrangling is applied in OpenRefine and R to map the original data to Darwin Core as an event core, occurrence extension and an DNA derived data extension.
  6. The Darwin Core views are connected to the INBO IPT and documented with metadata.
  7. The dataset is published and registered with GBIF.

書誌情報の引用

  1. Dekeukeleire, D., & Veltjen, E. (2025). DMP voor inventarisatie (kraam)kolonies van vleermuizen op warme zolders: versie 1. Instituut voor Natuur‐ en Bosonderzoek, België. https://pureportal.inbo.be/nl/publications/dmp-voor-inventarisatie-kraamkolonies-van-vleermuizen-op-warme-zo/

追加のメタデータ

We would like to thank the owners of the buildings that were surveyed in this dataset. Furthermore, we would like to thank the volunteers for their input in creating the dataset.