Описание
Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium is a sampling event dataset published by the Research Institute of Nature and Forest (INBO). This dataset contains observations of a survey of attics of old buildings (mainly churches, but also other historic buildings) at which (presumably) bat droppings were collected and identified using DNA barcoding (16S of CytB).
The dataset is published as a standardized Darwin Core Archive and includes for each sampling event an eventID, date, location and event remarks l (in the event core), and for each occurrence an occurrenceID, status, scientific name, taxon rank, materialSampleID, materialEntityID and remarks about material entity, occurrence or identification (in the occurrence extension), beside a target gene, forward and reverse primer and sequencing method (in the DNA derived data extension).
We have released this dataset to the public domain under a Creative Commons Zero waiver. We would appreciate it if you follow the INBO norms for data use (https://www.inbo.be/en/norms-data-use) when using the data. If you have any questions regarding this dataset, don't hesitate to contact us via the contact information provided in the metadata or via opendata@inbo.be.
Записи данных
Данные этого sampling event ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 541 записей.
Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Dekeukeleire D, Adriaensens L, Boers K, Brosens D, Cooleman S, De Man T, Dekeyser L, Halfmaerten D, Neyrinck S, Schepers R, Van Liefferinge N, Vandendriessche B, Vermeiren H, Verschaeve L, Willems W (2025). Bat droppings DNA survey in attics of historic buildings, Flanders, Belgium. Version 1.0. Research Institute for Nature and Forest (INBO). Samplingevent dataset. https://ipt.inbo.be/resource?r=bat-droppings-dna-survey-occurrences&v=1.0
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Research Institute for Nature and Forest (INBO). Насколько это возможно по закону, издатель отказался от всех прав на эти данные и посвятил их Public Domain (CC0 1.0). Пользователи могут без ограничений копировать, изменять, распространять и использовать работу, в том числе в коммерческих целях.
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 8062606b-4326-47a6-b89d-7a4c33b98f51. Research Institute for Nature and Forest (INBO) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Belgian Biodiversity Platform.
Ключевые слова
Samplingevent; Bats; attics; DNA-barcoding; faeces; Flanders
Контакты
- Metadata Provider ●
- Originator ●
- Point Of Contact
https://orcid.org/0000-0003-0664-8396
- Originator
- Originator
- Originator
- Metadata Provider ●
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
Географический охват
Belgium
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [50,02, 2,61], Север Восток [51,5, 5,89] |
|---|
Таксономический охват
The target species of this dataset are bats (Chiroptera species). Other species recorded (mainly rodents and shrews) are also included.
| Kingdom | Animalia |
|---|---|
| Class | Mammalia |
| Order | Chiroptera |
Временной охват
| Дата начала / Дата окончания | 1995-08-07 / 2025-01-08 |
|---|
Методы сбора
Presumably bat droppings (fecal samples) were collected using pincers and stored in an eppendorf tube with absolute ethanol until DNA extraction. It was tried to collect the most recent dropping.
| Охват исследования | 534 sites across Flanders were visited, mainly attics of churches and other historical buildings, to inspect for roosting bats. For species identification, presumably bat droppings were collected. Most sites were only visited once. Species identification was done using DNA barcoding (targeting a fragment of mitochondrial genes 16S of CytB). |
|---|---|
| Контроль качества | Data are collected using predefined sampling protocols. |
Описание этапа методики:
- Researchers from INBO and Natuurpunt Studie define and document the appropriate sampling protocols for the target species.
- Based on fieldwork and site visits, samples and data are collected by experts and specialized volunteers, using the predefined sampling protocols.
- Based on laboratory analyses, taxon identifications are assigned to the original data in Google sheets.
- Datacleaning in R en checks on map in QGIS.
- A custom data wrangling is applied in OpenRefine and R to map the original data to Darwin Core as an event core, occurrence extension and an DNA derived data extension.
- The Darwin Core views are connected to the INBO IPT and documented with metadata.
- The dataset is published and registered with GBIF.
Библиографические ссылки
- Dekeukeleire, D., & Veltjen, E. (2025). DMP voor inventarisatie (kraam)kolonies van vleermuizen op warme zolders: versie 1. Instituut voor Natuur‐ en Bosonderzoek, België. https://pureportal.inbo.be/nl/publications/dmp-voor-inventarisatie-kraamkolonies-van-vleermuizen-op-warme-zo/
Дополнительные метаданные
We would like to thank the owners of the buildings that were surveyed in this dataset. Furthermore, we would like to thank the volunteers for their input in creating the dataset.
| Альтернативные идентификаторы | https://ipt.inbo.be/resource?r=bat-droppings-dna-survey-occurrences |
|---|