Checklist

DAISIE - Inventory of alien invasive species in Europe

Dernière version Publié par Research Institute for Nature and Forest (INBO) le 12 juin 2020 Research Institute for Nature and Forest (INBO)
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Date de publication:
12 juin 2020
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

The DAISIE - inventory of alien invasive species in Europe is a species checklist dataset published by the Research Institute for Nature and Forest (INBO) and the Centre for Ecology and Hydrology (CEH). It contains information on 12,104 taxa (mostly species and mostly introduced) occurring in the wild in Europe since 1500. It covers a broad taxonomic spectrum of terrestrial and aquatic free living and parasitic organisms. The collation of the alien species list is the result of the efforts of the DAISIE (http://www.europe-aliens.org/) project partners and more than 300 collaborators from Europe and neighbouring countries, involved in different fields of expertise and organisations. Here the DAISIE checklist is published as a standardized Darwin Core Archive and includes for each species: the scientific name, higher classification, and stable taxon identifier (in the taxon core), the vernacular names (in the vernacular names extension), the presence in a specific region, the year of the first introduction (first collection) and/or last assessment/observation in that region, as well as extra information (in the distribution extension), and the habitat, native range, and ecofunctional group (in the description extension). The DAISIE dataset is no longer maintained, but can be used as a historical archive for researching and managing alien plants or compiling regional and national registries of alien species. Issues with the dataset can be reported at https://github.com/trias-project/daisie-checklist

We have released this dataset under a Creative Commons Attribution license (CC-BY 4.0). We would appreciate it if you follow the GBIF citation guidelines (https://www.gbif.org/citation-guidelines) when using the data. If you have any questions regarding this dataset, don’t hesitate to contact us via the contact information provided in the metadata or via https://twitter.com/trias_project.

The publication of the checklist to GBIF was supported by the European Cooperation in Science and Technology (COST) action Alien CSI “CA17122 - Increasing understanding of alien species through citizen science” as a Short Term Scientific Mission “Publishing alien species checklist data for Europe through repeatable, open workflows”, with technical support provided by the Research Institute for Nature and Forest (INBO).

Enregistrements de données

Les données de cette ressource checklist ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 12 115 enregistrements.

3 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Taxon (noyau)
12115
Distribution 
62162
Description 
48058
VernacularName 
17070

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Roy D, Alderman D, Anastasiu P, Arianoutsou M, Augustin S, Bacher S, Başnou C, Beisel J, Bertolino S, Bonesi L, Bretagnolle F, Chapuis J L, Chauvel B, Chiron F, Clergeau P, Cooper J, Cunha T, Delipetrou P, Desprez-Loustau M, Détaint M, Devin S, Didžiulis V, Essl F, Galil B S, Genovesi P, Gherardi F, Gollasch S, Hejda M, Hulme P E, Josefsson M, Kark S, Kauhala K, Kenis M, Klotz S, Kobelt M, Kühn I, Lambdon P W, Larsson T, Lopez-Vaamonde C, Lorvelec O, Marchante H, Minchin D, Nentwig W, Occhipinti-Ambrogi A, Olenin S, Olenina I, Ovcharenko I, Panov V E, Pascal M, Pergl J, Perglová I, Pino J, Pyšek P, Rabitsch W, Rasplus J, Rathod B, Roques A, Roy H, Sauvard D, Scalera R, Shiganova T A, Shirley S, Shwartz A, Solarz W, Vilà M, Winter M, Yésou P, Zaiko A, Adriaens T, Desmet P, Reyserhove L (2020): DAISIE - Inventory of alien invasive species in Europe. v1.7. Research Institute for Nature and Forest (INBO). Dataset/Checklist. https://ipt.inbo.be/resource?r=daisie-checklist&v=1.7

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Research Institute for Nature and Forest (INBO). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 39f36f10-559b-427f-8c86-2d28afff68ca.  Research Institute for Nature and Forest (INBO) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Belgian Biodiversity Platform.

Mots-clé

Checklist; Inventorythematic; checklist; inventory; alien species; Europe; AlienCSI

Contacts

David Roy
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Créateur
  • Personne De Contact
Centre for Ecology & Hydrology
GB
David Alderman
  • Créateur
CEFAS Weymouth Laboratory
Pauline Anastasiu
  • Créateur
University of Bucharest
RO
Margarita Arianoutsou
  • Créateur
University of Athens
GR
Sylvie Augustin
  • Créateur
Institut National de la Recherche Agronomique, Zoologie Forestière, Centre de recherche d’Orléans
FR
Sven Bacher
  • Créateur
Department of Biology, Ecology & Evolution Unit, University of Fribourg
CH
Corina Başnou
  • Créateur
Centre for Ecological Research and Forestry Applications, Campus de Bellaterra
ES
Jean-Nicolas Beisel
  • Créateur
Laboratory Biodiversity and Ecosysteme Functioning, University of Metz
FR
Sandro Bertolino
  • Créateur
Laboratory of Entomology and Zoology, DIVAPRA, University of Turin
IT
Laura Bonesi
  • Créateur
Dipartimento di Biologia, Università di Trieste
IT
François Bretagnolle
  • Créateur
Muséum National d’Histoire Naturelle, Département Ecologie et Gestion de la Biodiversité
FR
Jean Louis Chapuis
  • Créateur
Muséum National d’Histoire Naturelle, Département Ecologie et Gestion de la Biodiversité
FR
Bruno Chauvel
  • Créateur
UMR, INRA/ENESAD/UB, Biologie et Gestion des Adventices
FR
François Chiron
  • Créateur
Department of Ecology, Systematics and Evolution, The Institute of Life Sciences, The Hebrew University of Jerusalem
IL
Philippe Clergeau
  • Créateur
Institut National de la Recherche Agronomique, SCRIBE, IFR 140, Campus de Beaulieu
FR
Jonathan Cooper
  • Créateur
Centre for Ecology & Hydrology
GB
Teresa Cunha
  • Créateur
teresa.cunha@ec.europa.eu
BE
Pinelopi Delipetrou
  • Créateur
University of Athens, Faculty of Biology, Department of Botany
GR
Marie-Laure Desprez-Loustau
  • Créateur
Institut National de la Recherche Agronomique, Domaine de la Grande Ferrade, UMR 1202 BIOGECO, Pathologie forestière
FR
Mathieu Détaint
  • Créateur
Association Cistude Nature
FR
Simon Devin
  • Créateur
Laboratory Biodiversity and Ecosysteme Functioning, University of Metz
FR
Viktoras Didžiulis
  • Créateur
Coastal Research and Planning Institute, Klaipėda University
LT
Franz Essl
  • Créateur
Vienna University
AT
Bella S. Galil
  • Créateur
National Institute of Oceanography
IL
Piero Genovesi
  • Créateur
Chair European Section IUCN SSC ISSG, INFS (National Wildlife Institute)
IT
Francesca Gherardi
  • Créateur
Dipartimento di Biologia Evoluzionistica, Università di Firenze
IT
Stephan Gollasch
  • Créateur
GoConsult
DE
Martin Hejda
  • Créateur
Department of Invasion Ecology, Institute of Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic
CZ
Philip E. Hulme
  • Créateur
National Centre for Advanced Bio-Protection Technologies
NZ
Melanie Josefsson
  • Créateur
Swedish Environmental Protection Agency, c/o Department of Environmental
SE
Salit Kark
  • Créateur
Department of Ecology, Systematics and Evolution, The Institute of Life Sciences, The Hebrew University of Jerusalem
IL
Kaarina Kauhala
  • Créateur
Turku Game and Fisheries Research
FI
Marc Kenis
  • Créateur
Forestry and Ornamental Pest Research, CABI Europe
CH
Stefan Klotz
  • Créateur
Helmholtz Centre for Environmental Research – UFZ, Department of Community Ecology
DE
Manuel Kobelt
  • Créateur
Community Ecology, Zoological Institute, University of Bern
CH
Ingolf Kühn
  • Créateur
Helmholtz Centre for Environmental Research – UFZ, Department of Community Ecology
DE
Philip W. Lambdon
  • Créateur
RSPB, c/o Royal Botanic Gardens, Kew
GB
Tor-Björn Larsson
  • Créateur
European Environment Agency
DK
Carlos Lopez-Vaamonde
  • Créateur
Institut National de la Recherche Agronomique, Zoologie Forestière, Centre de recherche d’Orléans
FR
Olivier Lorvelec
  • Créateur
Institut National de la Recherche Agronomique, UMR ESE, INRA
FR
Hélia Marchante
  • Créateur
Escola Superior Agrária de Coimbra Departamento de Ciências Exactas e Ambiente Sector de Biologia e Ecologia
PT
Dan Minchin
  • Créateur
Marine Organism Investigations
IE
Wolfgang Nentwig
  • Créateur
Community Ecology, Zoological Institute, University of Bern
CH
Anna Occhipinti-Ambrogi
  • Créateur
Dipartimento di Ecologia del Territorio, Università di Pavia
IT
Sergej Olenin
  • Créateur
Coastal Research and Planning Institute, Klaipėda University
LT
Irina Olenina
  • Créateur
Coastal Research and Planning Institute, Klaipeda University
LT
Irina Ovcharenko
  • Créateur
Coastal Research and Planning Institute
LT
Vadim E Panov
  • Créateur
Faculty of Geography and Geoecology, St. Petersburg State University
RU
Michel Pascal
  • Créateur
Institut National de la Recherche Agronomique
FR
Jan Pergl
  • Créateur
Department of Invasion Ecology, Institute of Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic
CZ
Irena Perglová
  • Créateur
Department of Invasion Ecology, Institute of Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic
CZ
Joan Pino
  • Créateur
Centre for Ecological Research and Forestry Applications, Campus de Bellaterra, Uníversitat Autònoma de Barcelona
ES
Petr Pyšek
  • Créateur
Department of Invasion Ecology, Institute of Botany, Academy of Sciences of the Czech Republic
CZ
Wolfgang Rabitsch
  • Créateur
Federal Environment Agency Ltd, Biodiversity and Nature Conservation
AT
Jean-Yves Rasplus
  • Créateur
Institut National de la Recherche Agronomique, INRA, Centre de Biologie et de Gestion des Populations, Campus International de Baillarguet
FR
Biren Rathod
  • Créateur
Biological Records Centre, Centre for Ecology & Hydrology
GB
Alain Roques
  • Créateur
Institut National de la Recherche Agronomique, Zoologie Forestière, Centre de recherche d’Orléans
FR
Helen Roy
  • Créateur
Biological Records Centre, Centre for Ecology & Hydrology
GB
Daniel Sauvard
  • Créateur
Institut National de la Recherche Agronomique, Zoologie Forestière, Centre de recherche d’Orléans
FR
Riccardo Scalera
Tamara A. Shiganova
  • Créateur
P.P. Shirshov Institute of Oceanology, Russian Academy of Sciences
RU
Susan Shirley
  • Créateur
Department of Forest Science, Oregon State Universit
US
Assaf Shwartz
  • Créateur
Department of Ecology, Systematics and Evolution, The Institute of Life Sciences, The Hebrew University of Jerusalem
IL
Wojciech Solarz
  • Créateur
Institute of Nature Conservation, Polish Academy of Sciences
PL
Montserrat Vilà
  • Créateur
Estación Biológica de Doñana
ES
Marten Winter
  • Créateur
Helmholtz Centre for Environmental Research – UFZ, Department of Community Ecology
DE
Pierre Yésou
  • Créateur
Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage
FR
Anastasija Zaiko
  • Créateur
Coastal Research and Planning Institute, Klaipėda University
LT
Tim Adriaens
  • Créateur
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Peter Desmet
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Créateur
Research Institute for Nature and Forest (INBO)
BE
Lien Reyserhove
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Créateur
Research Institute for Nature and Forest (INBO)

Couverture géographique

This checklist contains documented introduction records of the alien taxa for 71 terrestrial and nine marine regions of Europe, the Levantine Basin and the North African coast of the Mediterranean Sea. These regions mostly match political borders of countries as they are known today. Where data were available at a finer political or biogeographic level, these are also presented e.g., the administrative regions of the United Kingdom (Wales, Scotland, England, Northern Ireland) or islands such as Corsica, Sicily, Crete, Greenland or Svalbard.

Enveloppe géographique Sud Ouest [27,68, -23,2], Nord Est [70,96, 43,94]

Couverture taxonomique

In total, this dataset includes taxa from 5 kingdoms and 53 phyla recorded in the database. The phyla of Spermatophyta, Arthropoda and Chordata contain the highest numbers of the alien species: 56, 24 and 5 %, respectively. Many phyla (32 out of 53) contain less than 10 recorded species, and 12 phyla are represented by only one recorded alien species.

Kingdom Plantae (plants), Animalia (animals), Fungi (fungi), Bacteria (bacteria), Chromista

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 1500-01-01 / 2005-12-31

Méthodes d'échantillonnage

See DAISIE (2009)

Etendue de l'étude See DAISIE (2009)
Contrôle qualité See DAISIE (2009) and step description.

Description des étapes de la méthode:

  1. The source data is extracted from the DAISIE database, a MySQL database managed by the Centre for Hydrology and Ecology (CEH).
  2. Multiple raw data files were generated from this database to make the mapping process more structured and easy to comprehend. These raw files were uploaded to a GitHub repository (https://github.com/trias-project/daise-checklist. See https://trias-project.github.io/daisie-checklist/ for an introduction to this repository and the mapping of this dataset.
  3. We developed multiple RMarkdown scripts to document and perform the transformation of the data to Darwin Core, which includes the following steps:
  4. Perform some basic data processing and restructuring (https://trias-project.github.io/daisie-checklist/1_pre_processing.html).
  5. Create a taxon core file (http://rs.gbif.org/core/dwc_taxon.xml) including cleaning of the taxon rank information (https://trias-project.github.io/daisie-checklist/2_dwc_taxon_mapping.html).
  6. Create a vernacular name extension (https://trias-project.github.io/daisie-checklist/3_dwc_vernacularname_mapping.html).
  7. Create a distribution extension file (http://rs.gbif.org/extension/gbif/1.0/distribution.xml, including standardization of the location information, occurrence status, means of establishment and event dates (https://trias-project.github.io/daisie-checklist/4_dwc_distribution_mapping.html).
  8. Create a description extension file (http://rs.gbif.org/extension/gbif/1.0/description.xml), including information about habitat, native range, and ecofunctional group (https://trias-project.github.io/daisie-checklist/5_dwc_description_mapping.html).
  9. The resulting Darwin Core data files are uploaded to the INBO IPT and documented with metadata.
  10. The dataset is published and registered with GBIF.

Citations bibliographiques

  1. DAISIE (2009) Handbook of alien species in Europe. Springer, Dordrecht ISBN 978-1-4020-8279-5, available by 17 November 2008

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs 39f36f10-559b-427f-8c86-2d28afff68ca
https://ipt.inbo.be/resource?r=daisie-checklist